Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms