Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms