Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms