Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms