Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms