Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PgrQ00175 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PgrQ00175 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PgrQ00175 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms