Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AlkP97793 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlkP97793 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlkP97793 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlkP97793 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AlkP97793 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AlkP97793 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
AlkP97793 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlkP97793 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AlkP97793 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AlkP97793 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AlkP97793 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AlkP97793 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AlkP97793 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AlkP97793 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AlkP97793 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlkP97793 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlkP97793 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms