Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cct3P80318 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms