Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms