Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps17P63276 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps17P63276 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps17P63276 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms