Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms