Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms