Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snrpd3P62320 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms