Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snrpd1P62315 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snrpd1P62315 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snrpd1P62315 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snrpd1P62315 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snrpd1P62315 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snrpd1P62315 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms