Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms