Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps11P62281 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms