Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2kP61087 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms