Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ActbP60710 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ActbP60710 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ActbP60710 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ActbP60710 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ActbP60710 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ActbP60710 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ActbP60710 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ActbP60710 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ActbP60710 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ActbP60710 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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ActbP60710 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ActbP60710 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ActbP60710 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ActbP60710 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ActbP60710 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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ActbP60710 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ActbP60710 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ActbP60710 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ActbP60710 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ActbP60710 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ActbP60710 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ActbP60710 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ActbP60710 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ActbP60710 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ActbP60710 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ActbP60710 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ActbP60710 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ActbP60710 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ActbP60710 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ActbP60710 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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