Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms