Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms