Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Setd4P58467 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Setd4P58467 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms