Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms