Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtnsP57757 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtnsP57757 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtnsP57757 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtnsP57757 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms