Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp25P57080 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp25P57080 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp25P57080 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp25P57080 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms