Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp5P56399 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp5P56399 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp5P56399 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp5P56399 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp5P56399 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms