Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GemP55041 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GemP55041 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GemP55041 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GemP55041 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GemP55041 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GemP55041 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms