Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms