Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad23aP54726 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms