Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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