Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RabggtbP53612 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms