Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux1P53564 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cux1P53564 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cux1P53564 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms