Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms