Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms