Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MipP51180 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MipP51180 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MipP51180 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MipP51180 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MipP51180 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MipP51180 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms