Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TubP50586 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TubP50586 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TubP50586 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TubP50586 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TubP50586 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms