Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms