Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd1P48410 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms