Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfx2P48379 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx2P48379 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms