Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VdrP48281 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VdrP48281 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VdrP48281 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VdrP48281 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VdrP48281 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VdrP48281 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VdrP48281 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VdrP48281 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VdrP48281 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VdrP48281 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VdrP48281 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VdrP48281 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VdrP48281 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms