Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Epb41P48193 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Epb41P48193 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Epb41P48193 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Epb41P48193 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Epb41P48193 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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