Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms