Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd1P40201 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms