Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms