Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grin2aP35436 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grin2aP35436 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms