Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms