Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc1P29341 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms