Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprmP28828 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprmP28828 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprmP28828 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprmP28828 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprmP28828 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprmP28828 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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