Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxraP28700 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxraP28700 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RxraP28700 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RxraP28700 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RxraP28700 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RxraP28700 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RxraP28700 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxraP28700 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxraP28700 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxraP28700 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxraP28700 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxraP28700 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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