Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BgnP28653 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BgnP28653 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BgnP28653 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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