Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms